Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttc21bQ0HA38 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc21bQ0HA38 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms