Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ssrp1Q08943 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms