Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gata4Q08369 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms