Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgm3Q08189 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms