Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ebf1Q07802 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms