Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col17a1Q07563 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col17a1Q07563 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms