Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Sh3bp2Q06649 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Sh3bp2Q06649 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Sh3bp2Q06649 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Sh3bp2Q06649 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Sh3bp2Q06649 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Sh3bp2Q06649 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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Sh3bp2Q06649 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bp2Q06649 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms