Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Cab39Q06138 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Cab39Q06138 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cab39Q06138 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Cab39Q06138 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cab39Q06138 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Cab39Q06138 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Cab39Q06138 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cab39Q06138 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Cab39Q06138 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cab39Q06138 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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