Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPINDOCQ05AH6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SPINDOCQ05AH6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms