Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dnal1Q05A62 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dnal1Q05A62 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms