Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms