Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smpd1Q04519 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smpd1Q04519 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms