Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RelaQ04207 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms