Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp11Q02853 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms