Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfiaQ02780 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms