Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlh1Q02576 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlh1Q02576 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 404.3 ms