Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ctnnb1Q02248 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctnnb1Q02248 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms