Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RykQ01887 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RykQ01887 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RykQ01887 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RykQ01887 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RykQ01887 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RykQ01887 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RykQ01887 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RykQ01887 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RykQ01887 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RykQ01887 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RykQ01887 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RykQ01887 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RykQ01887 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RykQ01887 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RykQ01887 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RykQ01887 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RykQ01887 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RykQ01887 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RykQ01887 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RykQ01887 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RykQ01887 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RykQ01887 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RykQ01887 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RykQ01887 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RykQ01887 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RykQ01887 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RykQ01887 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RykQ01887 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RykQ01887 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RykQ01887 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RykQ01887 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms