Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cacna1cQ01815 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cacna1cQ01815 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms