Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gbp1Q01514 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms