Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb2Q00977 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb2Q00977 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms