Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
F8a1Q00558 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms