Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gabpb1Q00420 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gabpb1Q00420 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms