Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Stx2Q00262 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms