Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbp10Q000W5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbp10Q000W5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms