Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cds1P98191 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cds1P98191 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cds1P98191 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cds1P98191 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cds1P98191 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Cds1P98191 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cds1P98191 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cds1P98191 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cds1P98191 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cds1P98191 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cds1P98191 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cds1P98191 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cds1P98191 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cds1P98191 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cds1P98191 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cds1P98191 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cds1P98191 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cds1P98191 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cds1P98191 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cds1P98191 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cds1P98191 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cds1P98191 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cds1P98191 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms