Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VldlrP98156 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms