Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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VegfcP97953 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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VegfcP97953 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VegfcP97953 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VegfcP97953 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfcP97953 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VegfcP97953 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VegfcP97953 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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VegfcP97953 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VegfcP97953 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VegfcP97953 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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VegfcP97953 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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VegfcP97953 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VegfcP97953 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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