Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn1bP97952 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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