Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
rp9P97762 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
rp9P97762 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
rp9P97762 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
rp9P97762 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
rp9P97762 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
rp9P97762 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
rp9P97762 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
rp9P97762 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
rp9P97762 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
rp9P97762 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms