Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Npas1P97459 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Npas1P97459 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Npas1P97459 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Npas1P97459 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Npas1P97459 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Npas1P97459 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Npas1P97459 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Npas1P97459 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Npas1P97459 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Npas1P97459 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Npas1P97459 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Npas1P97459 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Npas1P97459 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Npas1P97459 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Npas1P97459 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Npas1P97459 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Npas1P97459 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Npas1P97459 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Npas1P97459 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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