Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Bop1P97452 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Bop1P97452 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms