Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SmsP97355 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SmsP97355 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SmsP97355 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SmsP97355 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SmsP97355 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SmsP97355 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SmsP97355 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SmsP97355 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SmsP97355 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SmsP97355 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SmsP97355 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SmsP97355 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SmsP97355 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SmsP97355 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SmsP97355 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SmsP97355 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SmsP97355 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmsP97355 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmsP97355 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmsP97355 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SmsP97355 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SmsP97355 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmsP97355 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmsP97355 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmsP97355 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmsP97355 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmsP97355 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmsP97355 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmsP97355 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmsP97355 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmsP97355 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmsP97355 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmsP97355 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmsP97355 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmsP97355 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms