Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx1P80205 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Otx1P80205 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms