Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp9xP70398 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Usp9xP70398 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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