Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Msx3P70354 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Msx3P70354 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms