Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbx6P70327 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbx6P70327 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms