Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sycp3P70281 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms