Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxd13P70217 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hoxd13P70217 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms