Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SnrpnP63163 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SnrpnP63163 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpnP63163 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpnP63163 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpnP63163 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpnP63163 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpnP63163 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpnP63163 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpnP63163 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpnP63163 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SnrpnP63163 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpnP63163 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpnP63163 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SnrpnP63163 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpnP63163 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpnP63163 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpnP63163 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpnP63163 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpnP63163 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpnP63163 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpnP63163 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpnP63163 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpnP63163 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpnP63163 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpnP63163 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms