Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabrb3P63080 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabrb3P63080 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms