Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rps3P62908 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps3P62908 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms