Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rps28P62858 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rps28P62858 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms