Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp46P62069 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp46P62069 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp46P62069 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms