Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ube2kP61087 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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