Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab8bP61028 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab8bP61028 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab8bP61028 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab8bP61028 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab8bP61028 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms