Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sem1P60897 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sem1P60897 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sem1P60897 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sem1P60897 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms