Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ppfia3P60469 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ppfia3P60469 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms