Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ythdf1P59326 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf1P59326 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms