Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nup43P59235 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms